pH值可以更改水的化學構成，使水質產生質的轉變。對魚種日常生活標準而言，pH值較高時，水的化學構成開展穩步發展，pH值稍低時水的化學構成則開展惡循環。pH值稍低，土壤有機質溶解遲緩并且不充足，釋放出來很多有害物質，在其中首要的有CH4、CO2和H2S，這種汽體能破壞水體，有的汽體如H2S還能立即危害魚。因為有機化合物的酸化速率緩減，固氮菌生物主題活動能力降低，魚餌料生物也就不可以很多繁育起來，水體會愈來愈差。在酸性的水質中，一些化學物質的有機化學形狀會產生變化，如金屬離子的吸附能力變弱，乃至已吸附的被脫附，使水里懸浮固體增加。這種分離去的重金屬離子的毒性加重，可侵奪生物活性物質的活力遺傳基因，毀壞生物的酸系統軟件，使生物無法謀生，長此以往，生物感受積毒身亡。通過生產制造實踐經驗證明，如提升pH值到中性化或微偏堿，就會有很有可能降低乃至去除這種毒性。例如汞可由可塑性的一甲基汞有害物質變成二甲基汞蒸發自由散發出來產；鉛可被一些取代的生物吸附沉積；銅也可變成堿式硫酸銅毒沉積。這種積累的金屬材料毒性大大減少了。也有一些有毒氣體也發生了轉變，如H2S有毒，在提升pH值的情形下就變成HS-或S-無毒性的形狀存有；NH3有毒，在提升pH值的情形下可變成NH4 的形狀，就失去毒性；CO2盡管有毒，而在提升pH值的情形下，其毒性就明顯降低了。尤其是因為上列諸因素的轉變，立即造成溶氧的調節，一般來說，溶氧與pH值正相關關聯起伏。

水里營養元素也受pH值的危害。如磷在pH值6.5~8.5中間時，因化學沉淀或吸附固定不動所損害的聚磷酸鹽類相對性較少，又如高錳酸鹽指數，在pH值7~11中間時，毒性較小。總而言之我們要適度操縱pH值，使水質中的化工構成都能開展穩步發展。